农业自动气象站的结构基本相同，主要由传感器、采集器、系统电源、通信接口及外围设备等组成。传感器是自动气象站获得气象数据的关键设备，一般包含雨量传感、温湿度传感、低温传感、气压传感、风速风向传感等基本传感器。自动气象站的数据最后都在计算机上显示出来，并形成上传数据文件，同时生成各种报表进行上报和存档保存。
农业自动气象站有多种类型，包括土壤墒情监测站、自动雨量站、自动水位监测站、雨水情监测站、多要素自动气象站等。根据不同的功能和用途，可以配置不同的气象观测要素，例如组合成移动式气象站、固定式气象站、梯度观测站、墒情气象站、森林防火气象站、农林小气候观测站、高速公路气象站等多种不同使用用途的气象观测站。
农业自动气象站在农业生产中具有重要作用，可以帮助农民实时掌握天气变化，预测和预防自然灾害，提高农业生产效率和质量。同时，也为农业科研和农业生产管理提供了重要的数据支持。